OligoNem – In situ Methoden mit Oligochaeten und Nematoden zur Bestimmung der Sedimentqualität

Sedimente spielen eine entscheidende Rolle für biogeochemische Kreisläufe, und benthische Prozesse unterstützen oft die Basis der aquatischen Nahrungsketten. Allerdings sind Sedimente oft belastet und können als Schadstoffsenken eine Gefahr für die benthischen Lebensgemeinschaften darstellen. Selbst dann, wenn keine Anzeichen einer Belastung im Wasser erkennbar sind, können Sedimente das Funktionieren der Ökosysteme stören. Es ist daher entscheidend, die Sedimentqualität zu bewerten, um das Risiko für aquatische Ökosysteme zu bestimmen. Integrierte Verfahren für die Bewertung der Sedimentqualität verwenden nicht nur physico-chemische und ökotoxikologische Analysen, sondern auch In-situ-Indizes, die die Vielfalt und die Empfindlichkeit von makrobenthischen Gemeinschaften bewerten. Nematoden und Oligochaeten sind hier besonders nützlich. Um die Anwendung solcher Indizes zu fördern, soll unter anderem die Anwednung des französischen IOBS Index für Oligochaeten verbessert werden, indem neue DNA-basierten Monitoringmethoden (z.B. Barcoding) zu ihrer taxonomische Identifizierung verwendet werden. Darüber hinaus wird die Möglichkeit getestet, den deutschen NemaSPEAR Index für Nematoden in der Schweiz zu etablieren.

Publikationen

Pesce, S., Ferrari, B.J.D. et al. (2019) Recommandations d’un collectif franco-suisse d’experts pour une meilleure évaluation de la qualité écotoxicologique des sédiments par l’étude des communautés benthiques. Sciences Eaux & Territoires 55, 1-9
Download Artikel [PDF, 1876 kb]

Lefrançois, E., Apothéloz-Perret-Gentil, L., Blancher, P., Botreau, S., Chardon, C., Crepin, L., Cordier, T., Cordonier, A., Domaizon, I., Ferrari, B.J.D., Guéguen, J., Hustache, J.-C., Jacas, L., Jacquet, S., Lacroix, S., Mazenq, A.-L., Pawlowska, A., Perney, P., Pawlowski, J., Rimet, F., Rubin, J.-F., Trevisan, D., Vivien, R., Bouchez, A. (2018) Development and implementation of eco-genomic tools for aquatic ecosystem biomonitoring: the SYNAQUA French-Swiss program. Environmental Science and Pollution Research https://doi.org/10.1007/s11356-018-2172-2
Download von Springer

Vivien, R., Werner, I., Ferrari, B.J.D. (2018) Simultaneous preservation of the DNA quality, the community composition and the density of freshwater oligochaetes for the development of genetically based biological indices. PeerJ, DOI 10.7717/peerj.6050
Download Artikel [PDF, 232 kb]

Vivien, R., Holzmann, M., Werner, I., Pawlowski, J., Lafont, M. and Ferrari, B.J.D. (2017) Cytochrome c oxidase barcodes for aquatic oligochaete identification: development of a Swiss reference database. PeerJ, DOI 10.7717/peerj.4122
Download Artikel [PDF, 451 kb]

Vivien, R., Ferrari, B.J.D., Pawlowski, J. (2016) DNA barcoding of formalin‑fixed aquatic oligochaetes for biomonitoring. BMC Res Notes 9:342 DOI 10.1186/s13104-016-2140-1
Download Artikel 

Vivien, R., Lejzerowicz, F., Pawlowski, J. (2016) Next-Generation Sequencing of Aquatic Oligochaetes: Comparison of Experimental Communities. PLoS ONE 11(2): e0148644
Download Artikel

Vivien, R., Lafont, M. (2015) Note faunistique sur les oligochètes aquatiques de la région genevoise et de Suisse. Revue suisse de Zoologie, 122:207-212
Download von Ville de Genève